Rna-Seq Data Analysis: A Practical Approach

Opiniones de los lectores

Este libro es muy elogiado por su detallada introducción a la tecnología RNAseq, lo que lo hace ideal para principiantes y educadores en bioinformática. Cubre las aplicaciones prácticas de forma exhaustiva, incluye instrucciones de línea de comandos y proporciona ejemplos reales para facilitar el aprendizaje. Sin embargo, algunos usuarios señalaron problemas con la disponibilidad de datos de los sitios web recomendados y consideraron que ciertos aspectos técnicos, en particular los relacionados con R, estaban infrarrepresentados.

⬤ Muy práctico y completo
⬤ excelente para principiantes
⬤ incluye instrucciones paso a paso y ejemplos reales
⬤ bueno para la enseñanza
⬤ autocontenido y cubre varias herramientas y métodos de RNAseq.

⬤ No se pudo acceder a algunos conjuntos de datos
⬤ puede que no cubra todas las herramientas relevantes
⬤ sección infrarrepresentada sobre R
⬤ más orientado a bioinformáticos que a científicos de laboratorio húmedo.

(basado en 15 opiniones de lectores)

Contenido del libro:

Los datos de secuenciación de ARN (ARN-seq) ofrecen información sin precedentes sobre el transcriptoma, pero su aprovechamiento con herramientas bioinformáticas suele ser un cuello de botella. RNA-seq Data Analysis: A Practical Approach permite a los investigadores examinar la expresión diferencial a nivel de genes, exones y transcritos y descubrir nuevos genes, transcritos y transcriptomas completos.

Cada capítulo comienza con una base teórica, seguida de descripciones de herramientas de análisis relevantes y ejemplos prácticos. Los ejemplos, accesibles tanto para bioinformáticos como para científicos de laboratorio húmedo no programadores, ilustran el uso de herramientas de línea de comandos, R y otras herramientas de código abierto, como el software gráfico Chipster.

Llevando a los lectores a través de todo el flujo de trabajo de análisis de datos, esta guía autocontenida proporciona una visión detallada de los principales métodos de análisis de datos de ARN-seq y explica cómo utilizarlos en la práctica. Es adecuada para investigadores de una amplia variedad de campos, como la biología, la medicina, la genética y la informática. El libro también puede utilizarse en un curso de posgrado o de licenciatura avanzada.