Next-Generation DNA Sequencing Informatics, segunda edición

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Título original:

Next-Generation DNA Sequencing Informatics, Second Edition

Contenido del libro:

La tecnología de secuenciación de ADN de nueva generación (NGS) ha revolucionado la investigación biomédica, convirtiendo la secuenciación del genoma y el ARN en una herramienta asequible y de uso frecuente para una amplia variedad de aplicaciones de investigación, como el descubrimiento de variantes (mutaciones), la expresión génica, el análisis de factores de transcripción, la metagenómica y la epigenética. Los métodos bioinformáticos de apoyo a la secuenciación del ADN se han convertido y siguen siendo un cuello de botella crítico para muchos investigadores y organizaciones que desean hacer uso de la tecnología NGS. Esta nueva edición ofrece una introducción exhaustiva y en lenguaje sencillo a los métodos y herramientas informáticos necesarios para el análisis de datos NGS y proporciona descripciones detalladas de algoritmos, puntos fuertes y débiles de herramientas específicas, escollos y métodos alternativos. Cuatro nuevos capítulos cubren el diseño experimental, la preparación de muestras y la evaluación de la calidad de los datos NGS.

Bases de datos públicas para datos de secuenciación de ADN.

Ensamblaje de transcritos de novo.

Proteogenómica.

y las nuevas tecnologías de secuenciación. Los capítulos restantes de la primera edición se han actualizado con la información más reciente. Este libro también proporciona una amplia referencia a las mejores prácticas de métodos bioinformáticos para aplicaciones NGS y tutoriales para flujos de trabajo comunes. Esta edición aborda las necesidades informáticas de estudiantes, científicos de laboratorio y especialistas en informática que deseen aprovechar la explosión de oportunidades de investigación que ofrecen las nuevas tecnologías de secuenciación del ADN.

Autores

Alexander Alekseyenko.

Silvia Argim3n.

Brian D. Athey.

Miroslav Blumenberg.

Stuart M. Brown.

Lisa Cohen.

Efstratios Efstathiadis.

David Feny.

Jeremy Goecks.

Gerald A. Higgins.

D. Frank Hsu.

Kranti Konganti.

Konstantinos Krampis.

Guillermo I. Pérez-Pérez.

Kelly V. Ruggles.

Christina Schweikert.

Steven Shen.

Phillip Ross Smith.

Zuojian Tang.

Jinhua Wang.