Estadística y análisis de datos para micromatrices usando R y Bioconductor

Opiniones de los lectores

El libro es una guía completa sobre análisis de microarrays, programación en R y técnicas estadísticas aplicables a la genómica. Está bien escrito, con explicaciones claras y un estilo didáctico atractivo, lo que hace que los temas complejos sean accesibles para lectores de diversos orígenes. Aunque constituye un excelente recurso tanto para principiantes como para profesionales experimentados, algunas reseñas indican una falta de profundidad en ciertas áreas, en particular en lo que respecta a Bioconductor y al análisis de RNA-seq.

El libro es exhaustivo, rico en contenido y muy fácil de leer. Sirve como una gran referencia tanto para principiantes como para lectores experimentados, cubriendo temas esenciales en biología, estadística y programación R. El autor destaca por su capacidad didáctica y el uso del humor, así como por incluir ilustraciones en color que ayudan a comprender conceptos complejos. Muchos lectores aprecian las explicaciones detalladas y las ideas prácticas del autor, lo que lo convierte en un recurso inestimable para la bioinformática.

Algunos lectores encontraron el libro difícil de seguir a veces, en particular debido a los largos capítulos sobre estadística básica y programación R. Se criticó la insuficiente información sobre Bioconductor y el análisis de datos de micromatrices, lo que llevó a algunos a pensar que era necesario tener conocimientos previos. Además, varias reseñas mencionaron la redundancia en las explicaciones de estadística básica y la falta de profundidad percibida en el análisis de RNA-seq.

(basado en 18 opiniones de lectores)

Título original:

Statistics and Data Analysis for Microarrays Using R and Bioconductor

Contenido del libro:

Profusamente ilustrado en color, Statistics and Data Analysis for Microarrays Using R and Bioconductor, Second Edition proporciona una descripción clara y rigurosa de potentes técnicas de análisis y algoritmos para la extracción e interpretación de información biológica. Omitiendo detalles tediosos, formalismos pesados y notaciones crípticas, el texto adopta un enfoque práctico, basado en ejemplos, que enseña a los estudiantes los fundamentos de R y la tecnología de micromatrices, así como la forma de elegir y aplicar la herramienta de análisis de datos adecuada a problemas específicos.

Nuevo en la segunda edición.

Completamente actualizada y con el doble de tamaño que su predecesora, esta oportuna segunda edición sustituye el software comercial por los entornos de código abierto R y Bioconductor. Catorce nuevos capítulos cubren temas como los mecanismos básicos de la célula, cuestiones de fiabilidad y reproducibilidad en microarrays de ADN, estadística básica y modelos lineales en R, diseño de experimentos, comparaciones múltiples, control de calidad, preprocesamiento y normalización de datos, análisis de Gene Ontology, análisis de rutas y técnicas de aprendizaje automático. Los métodos se ilustran con ejemplos de juguete y datos reales, y el código R de todas las rutinas está disponible en un CD-ROM adjunto.

Con todos los prerrequisitos necesarios incluidos, este libro superventas guía a los estudiantes desde nociones muy básicas hasta técnicas avanzadas de análisis en R y Bioconductor. La primera mitad del texto presenta una visión general de los microarrays y los elementos estadísticos que forman los bloques de construcción de cualquier análisis de datos. La segunda mitad introduce las técnicas más utilizadas en el análisis de datos de microarrays.